Banii necesari lucrărilor au provenit dintr-o donaţie a împărătesei Maria Tereza, totodată Mare Principesă a Transilvaniei. Datorită unei erori de proiectare, turnul bisericii s-a prăbuşit la 22 septembrie 1779, făcând şi o victimă umană. Turnul a fost ridicat din nou, 3 ani mai târziu, sub îndrumarea arhitectului Johann Eberhard Blaumann.
Prima biserică a minoriţilor din Cluj a fost ridicată pe strada Lupilor (Kogălniceanu de astăzi). Stabiliţi pentru prima oară în oraş în 1486, în perioada reformei (1556), minoriţii au fost alungaţi si au primit aprobarea de a se reintoarce, numai în 1724, când au primit ordinul de a se stabili numai în afara zidurilor oraşului. Tradiţia spune că s-au aşezat undeva lângă Biserica Sfântul Petru, apoi, în jurul anului 1760, au cumpărat pe Bulevardul Eroilor de azi, casa Henter. Cinci ani mai târziu, minoriţii au primit aprobarea Consiliului de a se muta în ea. Aici au înfiinţat o casă de rugăciune şi, după multe negocieri, au cumpărat terenurile învecinate şi au decis să construiască o biserică.
Ridicarea bisericii s-a derulat, cel mai probabil, între 1778 şi 1779. Turnul a fost proiectat gresit şi, în septembrie 1779, acesta s-a dărâmat, afectând şi nava deja acoperită. Pentru reconstruirea turnului, Maria Tereza a făcut o donaţie. Frescele de pe cupolă au fost executate de pictorul Lohr Francisc în anul 1908. Înspre vest, biserica este lipită parţial de clădirea fostei mănăstiri a minoriţilor, cu care comunica printr-o usă. Se remarcă ferestrele, împodobite cu vitralii, reprezentând Sfinţii din Sinaxarul Bisericii Apusene. Geamurile poartă şi stema familiei Ioan Haller, nobil din Transilvania, fost patron al minoriţilor în secolul al XVIII-lea, precum şi insigna Ordinului Minoriţilor.
- Lukács József, Povestea „oraşului-comoară”: Scurtă istorie a Clujului şi monumentelor sale, Cluj-Napoca: Biblioteca Apostrof, 2005.
- Mircea Toca, Clujul Baroc, Cluj-Napoca: Dacia, 1983.
- Dorin Alicu, Mihai Gh. Cojocneanu (coord.), Cluj-Napoca de la începuturi până azi: (ghid istoric şi turistic), Cluj-Napoca: Clusium, 1995.
- Dragos Nicu, Cluj-Napoca oraş al monumentelor, ed., Cluj-Napoca: Studia, 2006.
- Francisc Orosz, Călăuza Clujului, Cluj-Napoca: Tipografia „Concordia”, 1933.
- Victor Lazar, Clujul, Bucureşti: Cultura Naţională, 1923.
- Ştefan Pascu, Iosif Pataki, Vasile Popa, Clujul, Cluj-Napoca: s.n., 1957.
- Gheorghe I. Bodea, Clujul vechi şi nou, Cluj-Napoca: PROF Image, 2002.